1990年，巩俐与张艺谋继续合作，主演其执导的家庭伦理电影《菊豆》，影片获得第43届戛纳国际电影节布努埃尔特别奖，并提名第63届奥斯卡金像奖最佳外语片奖，成为首部提名该奖的华语影片，巩俐在片中饰演为爱冒险的家庭妇女菊豆，亦凭借此片获得瓦尔纳国际电影节最佳女演员奖。

1991年，巩俐主演张艺谋执导的爱情伦理电影《大红灯笼高高挂》，影片获得第48届威尼斯国际电影节银狮奖，并提名第64届奥斯卡金像奖最佳外语片奖，同年应邀出席第64届奥斯卡金像奖颁奖典礼，巩俐在片中饰演具有反叛精神的四太太，凭借此片获得第16届大众电影百花奖最佳女主角奖，并提名第36届意大利电影大卫奖最佳外国女演员奖、美国国家影评人协会奖最佳女主角奖。

1992年，巩俐主演农村题材电影《秋菊打官司》，影片获得第49届威尼斯国际电影节金狮奖，巩俐在片中饰演倔强不屈的农村妇女秋菊，凭借此片获得第49届威尼斯国际电影节最佳女演员奖，成为中国内地首位威尼斯影后，此外巩俐获得第13届中国电影金鸡奖最佳女主角奖、日本影评人协会奖最佳女主角奖等奖项。

1993年，巩俐首次与陈凯歌导演合作，主演同性爱情伦理电影《霸王别姬》，影片获得第46届戛纳国际电影节金棕榈奖、英国电影学院奖最佳外语片奖，并提名奥斯卡金像奖最佳外语片奖等奖项，巩俐在片中饰演为爱牺牲的青楼妓女菊仙，凭借此片获得纽约影评人协会奖最佳女配角奖，并在2004年上榜美国《首映》杂志“影史百大伟大表演”榜单；同年，与周星驰合作了无厘头电影《唐伯虎点秋香》，该片获评香港1993年年度电影票房榜第一名，巩俐在片中饰演美丽端庄的秋香。

1994年，巩俐与张艺谋合作剧情片《活着》，影片获得第47届戛纳国际电影节评审团大奖等奖项，巩俐在片中饰演知书达理的母亲，凭借此片提名美国Chlotrudis电影奖最佳女主角奖；同年，在第四代导演黄蜀芹的电影《画魂》中饰演中国女画家潘玉良，影片入选戛纳国际电影节展映；同年，在冼杞然导演的合拍片《西楚霸王》中饰演刘邦的妻子吕后，并演唱该片的国语版主题曲。

1995年，巩俐主演张艺谋执导的电影《摇啊摇，摇到外婆桥》，在片中饰演上海滩歌舞厅的台柱小金宝，一位妖艳妩媚的“歌舞皇后”，并演唱了全片所有曲目，影片获得第48届戛纳国际电影节技术大奖、第53届美国电影电视金球奖最佳摄影奖、美国国家影评人协会奖最佳外语片奖等奖项，并提名第53届美国电影电视金球奖最佳外语片奖，巩俐应邀出席第53届美国电影电视金球奖颁奖典礼。

1996年，巩俐与陈凯歌、张国荣再次合作爱情电影《风月》，入围第49届戛纳国际电影节主竞赛单元，巩俐在片中饰演反叛的大小姐如意，凭借此片提名第16届香港电影金像奖最佳女主角奖；同年，巩俐登上美国《时代周刊》封面和德国《明镜周刊》封面。

1997年，巩俐主演了王颖执导的爱情电影《中国匣》，该片入围第54届威尼斯国际电影节主竞赛单元并获得最佳配乐奖，巩俐在片中饰演一位在香港谋生的大陆女薇薇安；同年，巩俐受邀担任第50届戛纳国际电影节主竞赛单元评审团成员，成为首位担任戛纳国际电影节主竞赛单元评委的华人。

1998年，巩俐被法国文化部授予法国艺术及文学勋章军官勋位。

1999年，巩俐与陈凯歌导演第三次合作，出演历史武侠电影《荆轲刺秦王》，在片中饰演深明大义的秦王嬴政青梅竹马赵姬，该片入围第52届戛纳国际电影节主竞赛单元并获得技术大奖。

2000年，巩俐担任第50届柏林国际电影节主竞赛单元评审团主席，成为首位担任欧洲三大国际电影节主竞赛单元评审团主席的华人；同年，巩俐与第五代导演孙周合作温情电影《漂亮妈妈》，出演一位自强不息的单身母亲孙丽英，凭借该片获得第24届蒙特利尔国际电影节最佳女主角奖、艺术成就奖，巩俐成为首位两度获得国际A类电影节最佳女主角奖的华语演员，此外巩俐凭借该片获得第20届中国电影金鸡奖最佳女主角奖、第24届大众电影百花奖最佳女主角奖。

2002年，巩俐受邀担任第59届威尼斯国际电影节主竞赛单元评审团主席，成为首位两度担任欧洲三大国际电影节主竞赛单元评审团主席的华人，也是首位担任威尼斯国际电影节主竞赛单元评审团主席的亚洲影人；同年，巩俐再次与孙周导演合作，在爱情电影《周渔的火车》中饰演文艺女青年周渔一角，凭借此片获得第10届北京大学生电影节最受欢迎女演员奖。

2003年，巩俐担任第16届东京国际电影节主竞赛单元评审团主席。

2004年，巩俐与香港导演王家卫合作了两部爱情电影《2046》与《爱神》，分别饰演赌徒苏丽珍和交际花华小姐，两部影片分别在戛纳国际电影节和威尼斯国际电影节参赛和参展；同年，在戛纳国际电影节上，巩俐被官方授予纪念大奖，以表彰其戛纳国际电影节的贡献和多次与最佳女主角奖失之交臂的遗憾。

2005年，巩俐参演描述日本艺伎的电影《艺伎回忆录》，该片获评美国《时代周刊》“年度十大佳片”第九名，获得第78届奥斯卡金像奖最佳艺术指导奖、最佳摄影奖、最佳服装设计奖等奖项，巩俐凭借片中艺伎馆的当红头牌初桃一角获得第77届美国国家评论协会奖最佳女配角奖等奖项，获评美国《首映》杂志2005年度“最佳表演24强”之最佳女配角第3名。

2006年，巩俐一共有三部大片在全球范围内上映，其中与张艺谋再次合作，与周润发、周杰伦合作的古装宫廷情感电影《满城尽带黄金甲》被美国《时代》周刊评选为“2006年全球十大最佳电影”之一，巩俐在片中饰演隐忍大气的皇后，并凭借该角色获得第26届香港电影金像奖最佳女主角奖、第12届香港电影金紫荆奖最佳女主角奖、第13届香港电影评论学会大奖最佳女演员奖等众多奖项，在美国《时代》评选的“年度最伟大表演”位列第7名，在《华盛顿邮报》评选的“世界5位最佳电影表演者”位列第2名；同年，在迈克尔·曼中的商业电影《迈阿密风云》中饰演一位古巴女毒枭，该片上映后获得北美电影票房榜周末冠军；此外，巩俐还上榜美国《时代周刊》“60年亚洲英雄”。

2007年，巩俐出演黑色恐怖电影《少年汉尼拔》，在片中扮演汉尼拔的婶婶，该片获得北美电影票房榜周末亚军和北美影碟销量榜冠军。

2010年，巩俐与约翰·库萨克、周润发主演英语战争题材电影《谍海风云》上映；同年，被法国文化部晋升为“艺术与文学勋章”司令勋位，成为首位获此荣誉的女性华人。

2011年，巩俐与刘德华合作主演翻拍自好莱坞同名喜剧《我知女人心》，在片中饰演一位创意十足的商业女强人李仪龙；同年，韩国中国电影节开展其个人作品回顾展。

2014年，巩俐与张艺谋再次合作文艺情感电影《归来》，在片中出演女主角冯婉瑜，一位为爱等待的凄苦女人；6月，巩俐出任第17届上海国际电影节评审团主席，这是她第四次担任国际A类电影节评审团主席；同年，巩俐二度上榜日本《电影旬报》“百大外国女星”。

2015年，巩俐受美国《VOGUE》主编安娜·温图尔邀请出任Met Ball（纽约大都会艺术博物馆慈善舞会）联合主席，成为首位担任此职的华人；同年，巩俐上榜《VOGUE》“你必须知道的7位中国女演员”，并入选联合国“艺术的变革力量之影响人类文化16人”画展；同年，巩俐入选联合国16位影响人类文化艺术家。

2016年2月8日，巩俐与郭富城等主演的古装武侠电影《西游记之孙悟空三打白骨精》上映，巩俐在片中饰演妖精白骨精。

2018年，受邀担任第55届台湾电影金马奖评审团主席。

2019年5月19日，获得第72届戛纳国际电影节组委会颁发的第5届“跃动她影”（Women In Motion）奖。

2020年9月11日，特别出演的迪士尼真人电影《花木兰》上映，巩俐在片中饰演女巫仙狼；9月25日，由陈可辛执导的电影《夺冠》在全国上映，巩俐在片中饰演中国女排总教练郎平；同年，获得新时代国际电影节庆祝新中国成立70周年全国十佳电影女演员奖。

2021年，凭借电影《夺冠》中郎平一角获得第1届澳涞坞影评人协会奖最佳女主角奖、第27届香港电影评论学会大奖最佳女演员奖、香港电影导演会2020年度奖最佳女主角；7月6日，担任第11届北京国际电影节天坛奖评委会主席；10月15日，与娄烨导演合作的电影《兰心大剧院》上映，该片入围第76届威尼斯国际电影节主竞赛单元，巩俐在片中饰演演员于堇。

2022年7月，第十二届北京国际电影节将首次设立艺术主席，并邀请演员巩俐担任。

2023年4月14日，巩俐主演《爱神之手(加长版)》将在日本上映。

2024年6月1日，凭借电影《兰心大剧院》中于堇一角获得中国电影导演协会2021年度女演员提名。10月，主演的视觉艺术短片《时间深处》上线。

1987年，张艺谋筹拍处女作《红高粱》，认识巩俐。

1989年，张艺谋和巩俐的感情曝光。

1995年，拍完《摇啊摇，摇到外婆桥》的最后一个镜头后，张艺谋宣布与巩俐分手。

2019年5月，法国电子音乐大师让-米歇尔·雅尔（Jean Michel Jarre）在伦敦和斯德哥尔摩举行《Electronica》巡回演唱会，途经法国巴黎，在一个朋友家里跟巩俐相识，第一次见面就感觉对方是自己正在寻找的人，甚至可以说是发现了另外一个自己，两人像是一见如故的老朋友。

在巩俐与张艺谋分手前，她就通过香港女作家梁凤仪认识了与张艺谋同岁的英美烟草公司亚太区总裁黄和祥。

1996年2月15日，巩俐与黄和祥结婚，圈内好友梅艳芳、林青霞等到场祝贺，并送上礼物。

2012年5月，经黄和祥证实两人已离婚三年，离婚原因是两人聚少离多，并分居多年。

2019年5月15日，法国电子音乐家让·米歇尔·雅尔（Jean-Michel Jarre）抵达戛纳，巩俐前往机场接机，两人全程紧紧牵手，甜蜜满满。

（注：不完全统计，仅收录国内一线杂志封面及其他重要封面）

2000年，巩俐被任命为联合国教科文组织“促进和平艺术家”；同年，在“世界粮食日”巩俐被任命为“民间大使”。

2001年，巩俐被聘请为2008年申奥形象大使。

2008年，联合国环境保护总部邀请巩俐担任全球环境保护大使，拍摄了环保海报并在全世界张贴。

2022年7月，将担任第十二届北京国际电影节艺术主席。

巩俐是一位在海内外都有关注度的华人女演员。（何明敏评）

她拥有美丽的外表，在《霸王别姬》里塑造的角色性格相当强势却有令人惊叹的优雅。（凯特·布兰切特评）

巩俐是在国际电影舞台作出过杰出贡献、并有着推广中华文化精神的华语女演员。（安娜·温图尔评）

她也是一个非常努力的演员，眼界远大，独行果断勇于承担，敢于面对每项挑战，虽然外界对她的评价不一致，但她仍是绝不简单的女人。

巩俐是一位面貌多样的优秀演员，她的表演功力、表演天赋、自身条件、和对角色的理解都很好。（王家卫评）

她对台词的处理能力，她在台词中所包含的感情幅度都把握的很好。（赵文瑄评）